אילת-אילות החלה את פעילותה בשנת 2006, כאגף במועצה האזורית של חבל אילות וב 2012 הפכה ליישות משפטית נפרדת בשם חל"צ אילת-אילות שהבעלים שלה הם עשרת הקיבוצים בערבה, חברות כלכלייות אזוריות, החממה הטכנולוגית הון הטבע ונציגי ציבור.
החזון של ראש המועצה דאז אודי גת, דורית בנט ונעם אילן שהיו ממיסדי אילת-אילות, סחף אחריו את קהילת טורונטו, מגבית קנדה והסוכנות היהודית שתמכו כספית לאורך 7 שנות המייזם הראשונות ועל כך נתונה תודתנו.
בריאן מדווד ז"ל (2002-1957) מקיבוץ סמר, היה מחלוצי האנרגיה הנקייה בארץ ותרם רבות מהידע שלו לעשייה המקומית, כמו גם יוסף אברמוביץ, מייסד חברת "ערבה פאור" שהקים את החברה המסחרית הראשונה בארץ ובערבה "ערבה פאור" יחד עם קיבוץ קטורה.
מאז 2012 ועד היום, החל"צ, כישות משפטית עצמאית נהנה מתמיכה כספית של הראשויות: אילת וחבל אילות, מהכנסות עצמיות וכספי קרנות, תרומות וקולות קוראים. מטרת החל"צ להמשיך ולהניע כלכלה מקיימת במרחב וכל הכספים מיועדים לפיתוח אזורי בהווה ובעתיד.